Tomoya est un jeune garçon au lycée. Il a redoublé et est considérer comme un délinquant par les autres élèves. Espérant que sa vie va changer, il laisse défiler les jours monotonnes. Mais un beau matin, il fait la connaissance de Nagisa, une élève timide mais bien mystérieuse. Tomoya vas l'aider à monter un club de théatre et à vaincre sa timiditée. 

Oz, un jeune homme de 15 ans, vit avec sa petite soeur Ada, son serviteur Gilbert,son oncle et ses domestiques dans une somptieuse maison. Lors de la cérémonie de maturation (cérémonie qui consiste à passer à l'âge adulte et à devenir duc), Oz se fait envoyer dans Abyss, un monde paralèlle où le temps n'est pas le même que chez nous. C'est dans cet endroit effrayant qu'il rencontre Alice, une Chain (c'est le nom donné aux créatures de l'Abyss) à l'apparence humaine. Elle demande à Oz de former un contrac avec elle pour pouvoir sortir d'Abyss. Oz accepte et se retrouve dans son monde en compagnie d'Alice. Un sceau déterminant le temps qu'il lui reste à vivre dans son monde est gravé sur son coeur. Oz sait donc qu'il devra retourner dans les profondeurs d' Abyss un jours ou l'autre avec Alice. Mais il ne s'en soussis pas pour le moment et commence à chercher les souvenirs d'Alice qu'elle a éparpillée dans ce monde. De même qu'Alice l'aide à chercher pourquoi il a été envoyer dans Abyss, qui est normalement une prison pour des personnes ayants commis de graves crimes.

 Son crime : exister - Son châtiment : oublier - Son salut : Pandora. De l’autre côté du miroir, la vérité est-elle pire que la réalité ?